FAT32, aunque es de Microsoft, ya ha caducado su patente y el driver es publico, por lo tanto, cualquier sistema operativo puede hacer que se puede tanto escribir, como leer de un disco duro en FAT32, pero tiene ya muchos años este sistema de ficheros y no permite grabar ficheros de más de 4GB, por eso salio NTFS.
Lo que te pasa con NTFS es lo que te comentaba, el driver, aunque algunos permiten escribir, te puede pasar que te borre todo el disco, porque su tabla de escritura cuando lo hace en el disco, no esta adaptada totalmente al disco NTFS y te puede escribir en zonas que te borren la cabecera de ficheros u otras cosas peores, por lo tanto, lo mejor es, si quieres usar archivos mayores a 4GB usar un sistema de archivos libres como son los ext de linux, los cuales seguramente estén soportados por Qviart.